Struktur Organisasi GKBI
| BIDANG PEMBINAAN |
| Pembinaan Penatua, Badan Pelayan, Umat |
| Seminar dan Pelatihan |
| BIDANG PERSEKUTUAN DAN PELAYANAN |
| Ibadah |
Pendalaman Alkitab |
| Persekutuan |
| Perlawatan |
| BIDANG SARANA PENUNJANG DAN UMUM |
| Administrasi Keanggotaan |
| Fasilitas dan Komunikasi |
| Kepanitiaan / Event |
| Kas Kecil |
Majelis Jemaat GKBI Periode 2018 – 2021
| Ketua | Benny Zakaria |
| Wakil Ketua | Eric A. Saputra |
| Sekretaris 1 | John Simangunsong |
| Sekretaris 2 | Hertina Sitompul |
| Bendahara 1 | Henny Sri Yuliati |
| Bendahara 2 | Meijarni Chen |
| Bidang Pembinaan Internal | Mico Siahaan |
| Bidang Pembinaan External | Edmond Sinulingga |
| Bidang Persekutuan | Pingkan Adeline |
| Bidang Pelayanan | Christian Girsang |
| Bidang Sarana Penunjang dan Umum | Mailanto Sitorus |