Struktur Organisasi GKBI
| BIDANG PEMBINAAN |
| Pembinaan Penatua, Badan Pelayan, Umat |
| Seminar dan Pelatihan |
| BIDANG PERSEKUTUAN DAN PELAYANAN |
| Ibadah |
Pendalaman Alkitab |
| Persekutuan |
| Perlawatan |
| BIDANG SARANA PENUNJANG DAN UMUM |
| Administrasi Keanggotaan |
| Fasilitas dan Komunikasi |
| Kepanitiaan / Event |
| Kas Kecil |
Majelis Jemaat GKBI Periode 2021 – 2024
| Ketua | Pnt. Benny Zakaria |
| Wakil Ketua | Pnt. John Simangunsong |
| Sekretaris | Pnt. Hertina Sitompul |
| Bendahara 1 (Accounting) | Pnt. Henny Yulianti |
| Bendahara 2 (Cash Management) | Pnt. Sonya Siagian |
| Bidang 1 Pembinaan | Pnt. Mico Siahaan Pnt. Edmon Sinulingga Pnt. Kristiawan Tri Nugroho |
| Bidang 2 Pelayanan & Persekutuan | Pnt. Christian Girsang Pnt. Pingkan Langi Pnt. Yoseph P Simandjuntak |
| Bidang 3 Sarana & Prasarana | Pnt. Mailanto Sitorus Pnt. Erry Ng |